Ключевая идея МСПИ — «личностно-ориентированное образование и практико-ориентированная подготовка»: фундаментальные гуманитарные знания + индивидуальные образовательные траектории + практика на партнёрских базах + цифровые образовательные технологии. Учебный процесс строится через факультеты, проектные и консультационные практики, внутренние учебно-производственные комплексы (кафедральные службы психолого-педагогического консультирования), а также курируемые стажировки в школах, центрах развития и реабилитации, соцслужбах и НКО.
Научная повестка охватывает вопросы инклюзии и коррекционной педагогики, прикладной психологии, методик обучения и воспитания, управления в системе образования и госуправления.